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n运输单分布隔间PK simbiology吸收模型

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丹尼尔·海恩斯
丹尼尔·海恩斯 2019年4月18日
编辑: 杰里米Huard 2019年4月26日
我已经建立了一个与单一distibutional n-transit室药代动力学使用SimBiology吸收模型。这个模型是基于交通模型种以下出版物:萨维奇,智慧化彼特,D.M.Kerbusch, t . et al . Pharmacokinet Pharmacodyn 34 (2007): 711。 https://doi.org/10.1007/s10928 - 007 - 9066 - 0
我选择先加载一个隔间吸收模型与间隙parmaeterization(宏观参数),然后修改了吸收反应方程n运输舱基于解析解来确定运输舱数量作为连续变量(而不是整数)。
分析解决方案的隔间:
n分析solution.PNG
单一分布间歌唱:
nTransit 1 comp ODE.PNG
变换的颂歌n很大时数值稳定:
ODE transform.PNG
武官总结报告是我在simbiology定义模型。
我不确定如果我用错了语法,但我看到负面cincentrations第一次模拟时间点由这仿真图如图所示:
sim.PNG
仿真应该是一个逐渐吸收阶段与典型tlag吸收simbiology PK模型中的模型库。
欢呼,
丹
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丹尼尔·海恩斯
丹尼尔·海恩斯 2019年4月18日
我试图recreat n交通PK吸收模型,在上述出版单位描述。
典型的滞后时间吸收模型相比,这种运输模式认为延迟吸收作为传输通过多个tansit隔间之前吸收。
此外,中转仓的数量通常定义为一个正整数的值。但在这种情况下,解决运输的数量和anlytical隔间包括所以n可能定义为一个非整数值。
的解决方案是定义为: ODE transform.PNG
在Aa是药物吸收部位的质量
* F是可用的吸收剂量,剂量
ktr运输速率常数
n是中转仓的数量
卡是中央室吸收速率常数
ktr可以定义的参数n和MTT(平均运输时间)
ktr.PNG
我试图定义这种交通模式首先加载一个隔间吸收模型从simbiology PK模型库,然后修改吸收通量方程上面的网站吸收药物的颂歌。
然而模拟400毫克剂量后我看到PK反应不是理解(负面集中在早期的时间点),告诉我有问题我如何定义模型。这是我看到的响应 sim.PNG
这是反应我想看(固体bacl曲线)相比toa滞后时间吸收模型(点缀黑色曲线):
交通与滞后响应plot.PNG PK
显然我不能上传simbiology项目文件这里如果有另一种方式你会喜欢我与我分享这个模型让m e知道。
err.PNG
这个模型是非常有用的与传统的PK吸收模型药物表现出缓慢或延迟吸收。滞后时间响应模型之间的一个简单的模型结构和大型PBPK模型。
我非常感谢帮助!
干杯
丹

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在回答这个问题。

答案(1)

Wojciech Krzyzanski
Wojciech Krzyzanski 2019年4月19日
亲爱的丹,
积极的投入到Aa舱和0初始值(Aa(0) = 0),你的氢氧化钠Aa (t)应该总是正的。你的模拟吸收曲线意味着ODE求解器的问题。既然你提到中转仓的数量很大,我认为这是一个刚度问题,你的ODE求解器不适合激烈的方程。你得到较小的n - Aa吗?大型ka刚度会发生。
问候,
Wojciech
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杰里米Huard
杰里米Huard 2019年4月25日
编辑:杰里米Huard 2019年4月26日
嗨,丹尼尔,
定义运输舱的方程只适用于单个丸。
但您可以修改重复计量方程代替“时间”的时候从这里推荐的剂量: https://dx.doi.org/10.1128%2FAAC.00461-07
在SimBiology您需要添加一个事件存储计量的时间。如果你量量是常数,这是所有你需要做的。如果你的剂量取决于模型参数数量,您可以修改剂量在这个事件。
我实现了这个在你的模型(见附件)。
编辑:这是错误的URL。我已经修正它。

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