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cophenet
コーフェン相关系数
构文
C = cophenet（Z，Y）
并[c，d] = cophenet（Z，Y）
说明
C = cophenet（Z，Y）は，žが表す阶层クラスターツリーのコーフェン相关系数を计算します。žは，关数连锁の出力です。ÿには，关数pdistによって出力されるžの作成に使用された距离または非类似度が含まれています。žは，3番目の列に距离情报のあるサイズが（间1）行3列の行列です。ÿは，サイズがM *（M-1）/ 2のベクトルです。
并[c，d] = cophenet（Z，Y）は，コーフェン距离dをÿと同じ下位三角距离ベクトル形式で返します。
クラスターツリーのコーフェン相关は，ツリーから得たコーフェン距离と，そのツリーを作成するときに使用された元の距离（非类似度）との间の线形相关系数で定义されます。これは，ツリーが観测间の非类似度をどれだけ忠実に表しているかの尺度になります。
2つの観测间のコーフェン距离は，系统树では2つの観测が最初に结合されたときのリンクの高さで表されます。高さがそのリンクで结合された2つのサブクラスター间の距离です。
出力値Cがコーフェン相关系数です。この値は解の精度が高いほど1に近づきます。この尺度は，さまざまなアルゴリズムを使用して得たクラスターの解を比较するときに使用できます。
Z（：，3）とÿの间のコーフェン相关系数は次のように定义されます。
ここで，
ÿIJは，
ÿに含まれているオブジェクト我とオブジェクトĴの距离です。žIJは，
Z（：，3）から得られるオブジェクト我とオブジェクトĴのコーフェン距离です。Ÿとžはそれぞれ
ÿとZ（：，3）の平均です。
例
X = [兰特（10,3）;兰特（10,3）+1;兰特（10,3）2];Y = pdist（X）;Z =键（Y， '平均'）;所述％相异处同表象距离之间计算％Spearman秩相关并[c，d] = cophenet（Z，Y）;R =科尔（Y 'd'， '类型'， '斯皮尔曼'）R = 0.8279
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