潘汤普金斯的完整实现;如果你发现这个脚本有用请引用以下引用,引用% %:% [1]Sedghamiz。H,”潘汤普金斯心电图QRS探测器的Matlab实现。”,2014年3月。https://www.researchgate.net/publication/313673153_Matlab_Implementation_of_Pan_Tompkins_ECG_QRS_detectAND% [2]平底锅。J,汤普金斯。W。J,“实时QRS检测算法”IEEE %生物医学工程事务,BME-32卷,没有。3、1985年3月。% % % %作者:Hooman Sedghamiz林雪平大学电子邮件:hoose792@student.liu。se %版权2014年3月- - - - - - - - - - - - - - - - - - % %方法:% % % 1)预处理带通滤波器(5 - 15赫兹)% 2)由此衍生滤波器高亮度QRS波群。% 3)信号的平方。% 4)噪声信号平均长度(0.150秒)。% 5)取决于信号的采样频率过滤%选项更改为最佳匹配你的ecg信号的特点% %决策规则算法%在这一点上,前阶段产生约脉冲形状% MWI的输出波形。确定是否这个脉冲%对应于一个QRS波群(而不是一个high-sloped让或噪音加工品)%执行与一个自适应的阈值操作和其他决定%规则下面;%)框标——首先处理波形产生一组加权样本单位% MWI最大值的位置。 This is done in order to localize the QRS% complex to a single instant of time. The w[k] weighting is the maxima value.% b) THRESHOLDING - When analyzing the amplitude of the MWI output, the algorithm uses% two threshold values (THR_SIG and THR_NOISE, appropriately initialized during a brief% 2 second training phase) that continuously adapt to changing ECG signal quality. The% first pass through y[n] uses these thresholds to classify the each non-zero sample% (CURRENTPEAK) as either signal or noise:% If CURRENTPEAK > THR_SIG, that location is identified as a “QRS complex% candidate” and the signal level (SIG_LEV) is updated:% SIG _ LEV = 0.125 ×CURRENTPEAK + 0.875× SIG _ LEV% If THR_NOISE < CURRENTPEAK < THR_SIG, then that location is identified as a% “noise peak” and the noise level (NOISE_LEV) is updated:% NOISE _ LEV = 0.125×CURRENTPEAK + 0.875× NOISE _ LEV% Based on new estimates of the signal and noise levels (SIG_LEV and NOISE_LEV,% respectively) at that point in the ECG, the thresholds are adjusted as follows:% THR _ SIG = NOISE _ LEV + 0.25 × (SIG _ LEV ? NOISE _ LEV )% THR _ NOISE = 0.5× (THR _ SIG)% These adjustments lower the threshold gradually in signal segments that are deemed to% be of poorer quality.% c) SEARCHBACK FOR MISSED QRS COMPLEXES - In the thresholding step above, if% CURRENTPEAK < THR_SIG, the peak is deemed not to have resulted from a QRS% complex. If however, an unreasonably long period has expired without an abovethreshold% peak, the algorithm will assume a QRS has been missed and perform a% searchback. This limits the number of false negatives. The minimum time used to trigger% a searchback is 1.66 times the current R peak to R peak time period (called the RR% interval). This value has a physiological origin - the time value between adjacent% heartbeats cannot change more quickly than this. The missed QRS complex is assumed% to occur at the location of the highest peak in the interval that lies between THR_SIG and% THR_NOISE. In this algorithm, two average RR intervals are stored,the first RR interval is % calculated as an average of the last eight QRS locations in order to adapt to changing heart % rate and the second RR interval mean is the mean % of the most regular RR intervals . The threshold is lowered if the heart rate is not regular % to improve detection.% d) ELIMINATION OF MULTIPLE DETECTIONS WITHIN REFRACTORY PERIOD - It is% impossible for a legitimate QRS complex to occur if it lies within 200ms after a previously% detected one. This constraint is a physiological one – due to the refractory period during% which ventricular depolarization cannot occur despite a stimulus[1]. As QRS complex% candidates are generated, the algorithm eliminates such physically impossible events,% thereby reducing false positives.% e) T WAVE DISCRIMINATION - Finally, if a QRS candidate occurs after the 200ms% refractory period but within 360ms of the previous QRS, the algorithm determines% whether this is a genuine QRS complex of the next heartbeat or an abnormally prominent% T wave. This decision is based on the mean slope of the waveform at that position. A slope of% less than one half that of the previous QRS complex is consistent with the slower% changing behaviour of a T wave – otherwise, it becomes a QRS detection.% Extra concept : beside the points mentioned in the paper, this code also% checks if the occured peak which is less than 360 msec latency has also a% latency less than 0,5*mean_RR if yes this is counted as noise
这个项目的主要目的是脑电图信号处理和分析。它包括以下步骤:1。收集数据库(大脑信号数据)。2。发展有效的EEG信号的去噪算法。3所示。使用有效的algorithm.4处理数据。开发在Time-Frequency.5 EEG信号分析的有效算法。脑电图信号频率analyzing6进行分类。信号处理和分析将通过使用MATLAB完成。
珠子共同解决同步的问题/趋势/基线漂移校正和(高斯分布、泊松分布)为一维信号降噪。设计产生积极的和稀疏信号的分析化学:色谱法、拉曼光谱、红外线、XRD、质谱等)。基线对应于慢变化趋势,仪器漂移或背景抵消。拟议的珠子基线滤波算法是基于建模的一系列(色谱)峰主要是积极的,稀疏与稀疏的衍生品,在基线建模为一个低通的信号。制定一个凸优化问题,以封装这些非参数模型。占色谱峰的积极性,非对称罚函数,类似于一个正规化的l1范数是利用。开发一个健壮的、计算效率,迭代算法,保证收敛到唯一的最优解。它实现了方法发表的论文“色谱基线估计和去噪使用稀疏(珠)”Xiaoran Ning,伊万·w·Selesnick Laurent所得钱款,在化学计量学和智能实验室系统,2014年12月,http://dx.doi.org/10.1016/j.chemolab.2014.09.014TheZIP文件包含两个Matlab函数:*一个演示脚本(example.m);*主要功能(beads.m)和一个html自述的帮助。珠子已经被用于1 d和2 d (GCxGC)色谱法、拉曼光谱、高分辨率质谱对于天文高光谱数据,脑电图(EEG)、心电图(ECG)、阿拉伯脚本分析、功率信号消除趋势监测。其他用途,实现在Python中,R和c++提供珠子页面:http://www.laurent-duval.eu/siva-beads-baseline-background-removal-filtering-sparsity.html
这个工具箱可以读和写在dicom医学图像数据格式与“readImages”功能。这个函数的输出是一个结构,它包含图像的属性或者体积。这种结构可以用作输入其他功能的工具箱。这个工具箱支持:-阅读和写万博1manbetx作的dicom数据映射体积的体素位置-斜片对齐和登记手册3 d图像旋转-选择和提取单一立体像素坐标绘制2 d或3 d的面具- coregistered图片查看支持PET / CT和PET /语法先生:CT = readImages ([CT_ImageDirectoryPath]);宠物= readImages ([PET_ImageDirectoryPath]);VolumeViewer3D (CT、PET) VolumeViewer3D (CT、PET、“对齐”,“修剪”)坐标= VolumeViewer3D (PET、CT、“getCoords”);面具= VolumeViewer3D (PET、CT、“drawROI”);
这个包包含了Matlab实现方法的代码组织分割和偏压场校正他李等人的论文:“乘法内在组件优化(MICO) MRI偏差估计和组织分割”,磁共振成像,32(7)卷,第923 - 913页,2014年MICO算法实现在这段代码中已经验证成千上万的图像,并表现出优于许多流行的算法的鲁棒性,效率和精度。可用于正常脑组织分割和偏见的图像数据字段先生估计/校正,并且没有参数调优的实现在这个包中。清晰准确的Matlab编写代码,很容易阅读和理解。用户和开发人员可以方便地用它来应用和进一步发展。我们正在优化实现更有效,以及修改算法,进一步提高性能。我们将上传新版本在以下这个网站或主页的网站http://imagecomputing.org/ ~ cmli /
:为了方便去除杂点过滤我们开发了在MATLAB®统一工具箱相结合的图像去除杂点过滤(IDF),纹理分析和图像质量评价技术自动化预处理和CCA补充疾病评价超声图像。软件,是基于一个图形用户界面(GUI),并采用了图像正常化,25个不同的去除杂点过滤技术(DsFlsmv、DsFwiener DsFlsminsc, DsFkuwahara, DsFgf, DsFmedian, DsFhmedian, DsFad, DsFnldif, DsFsrad等),图像亮度归一化,65材质特性,15量化图像质量指标和客观图像质量评价。可执行的软件也是公开的形式,可以下载http://www.cs.ucy.ac.cy/medinfo/。在BSD许可下发布
使用从UVicMUSE MuseUdp接收数据。分,它允许用户把脑电图ACC和陀螺数据。
心电图(ECG)、皮肤电活动(EDA)、肌电图(EMG)和阻抗图(ICG)等生理信号广泛应用于各种生物医学应用。Bio-SP工具旨在帮助机器学习和模式识别的研究人员从这些里面自动、可靠地提取特征矩阵。这个工具兼容MathWorks分类学习者应用模型等进一步分类培训、农业、交叉验证方案和分类结果计算。*请参考我们的论文“Biosignal-Specific处理工具对机器学习和模式识别”发表在2017年IEEE-NIH专题会议上医疗创新和现场即时技术(HI-POCT 2017)作为参考。
%作者:杨回族%关系:% 310年宾夕法尼亚州立大学% Leohard建筑,大学公园,PA %电子邮件:yanghui@gmail.com %如果你发现这个工具有用,请引用以下纸:% [1]h·杨,s . t . s . Bukkapatnam和r . Komanduri“时空%表示心脏心电向量图(向量)信号,”在线生物医学工程%,Vol.11, 16号,2012年,% DOI:http://dx.doi.org/10.1186/1475 - 925 x - 11 - 16%[2]刘g和h·杨,“多尺度自适应基函数建模%的时空心脏电信号,“IEEE生物医学期刊%和卫生信息学,17卷,2号p484 - 492, 2013年% DOI:http://dx.doi.org/10.1109/JBHI.2013.2243842%数据:ecgdata1。垫或ecgdata2。垫%样本数据包括12导的集合体ecg和3-lead向量%心跳周期长度可以保持原来的相同或重新取样。%原心跳周期长度(即。,RR间隔)存储在% Ensemble001.period
伴随着“羊描述睡眠纺锤波”(W施耐德等)研究论文。的一些通用方法遵循这些Sinergia SWA工具箱,虽然这里大量用于绵羊文件。主轴工作流程文件给运行代码示例。
这个工具箱包含以下files.README.pdfMain_DTSR。米(主文件DTSR) rec_codes文件夹(包含支持代码Main_DTSR运行。万博1manbetx(主文件))相关代码:P。Aggarwal和a·古普塔,“基于双颞稀疏加速压感觉到静息状态功能磁共振成像的重建”,第一版。医学杂志。地中海,91卷,第266 - 255页,2017年。https://doi.org/10.1016/j.compbiomed.2017.10.020
人类运动变化研究中心内布拉斯加州的奥马哈大学专门从事人类运动的非线性分析。我们免费提供我们的一些工具MATLAB非线性分析可以更广泛地使用。如果你使用这些脚本或修改请确认信贷研究中心大学人体运动变化的内布拉斯加州奥马哈的网站,访问日期。大部分的分析来自或受现有工作的学术文献。在适用情况下,这些都包含在单个脚本中的注释。这些评论提供使用说明的代码的开发和细节。我们要求你们在联系我们之前请先参考这些评论寻求帮助。如果你需要帮助请与我们联系:unobiomechanics@unomaha.edu.Nonlinear分析来自更高水平的数学和有些代码可能看起来简单,大部分的应用程序和背景复杂。我们建议你参考文献更好地理解这些应用程序和背景。非线性分析的核心设施,中心的一部分,还提供了一个为期一周的年度非线性分析车间我们教育参与者在这些方法。注册,请访问我们的年度非线性分析车间网页:https://www.unomaha.edu/college-of-education/biomechanics-core-facility/community-engagement/nonlinear-workshop.php
rodent_EEG_data_analysis_for_neuroscience
预测是一个快速替代布洛赫模拟模拟稳态核磁共振共振效应。使用多个加速模拟稳态脉冲序列的预测方程,快速傅里叶变换对信号目前包括质子密度,T2,和共振效应。目前模拟仅限于笛卡尔脉冲序列,但我们计划添加支持non-Cartesian脉冲序列。万博1manbetx例子包括:模拟易感性和金属构件周围空气。——模拟水脂转变(即化学位移)。——brainweb模拟数据集,包括T1, T2,敏感性,和水脂转变(Matlab R2015A或后自动下载数据集所需的)如果你在你的研究中使用预测,请包括一个参考我们的MRM纸和最近的链接代码:F。Zijlstra, J.G. Bouwman, Braskute,硕士Viergever,公关Seevinck,“快速Fourier-based模拟共振稳态梯度回波磁共振应用于金属工件对象定位”,增效。的原因。地中海,2016
这是容易的编译运行统计工具的事件相关的潜在的数据。我开始小,将定期更新与更多的测试工具箱。目前它只包含一个测试。测试运行一个点对点成对t检验对多个主题多信道的ERP数据输出和保存为文本罗斯福纠正p和t值。
ω的目的是双重的。首先,它被设计为允许简单、快速、有效的重建任何宠物数据,包括模拟通道数据。其次,它的目的是便于算法发展因为它允许容易matrix-free实施向前(* x)和向后(“* y)预测。
脑电图电极定位可能限制宝贵的时间对数据收集和繁重的研究人员和病人,特别是高密度脑电图(32 - 128通道)。‘叫莫洛,我们开发了一个算法来计算三维电极的坐标位置使用样条插值的一个子集。MoLo定位精度与手写笔数字转换器和camera-scanners,常见的临床研究。算法是特别有用的研究涉及儿童和那些不能为长时间保持静止。
这个项目准备在实现系统计算的要求一位运筹学理科生物医学工程,这是写在合作精神中心斯特鲁普(CNSR) Rigshospitalet,哥本哈根,丹麦。项目进行为期五个月的初从2017年2月,上月的2017年6月。项目涉及的提取声音从精神分裂症患者的访谈记录。这声音是那么对待和特性,可以用作生物标记提取的支持在这一领域的进一步研究。万博1manbetx项目评估的实现Matlab工具箱的音频分析t Giannakopoulos等人。(2014)。
fcnPseudoBmodeUltrasoundSimulator生成一个模拟伪b型超声图像的组织声学回声模型结构成像。同一幅图像矩阵的模拟图像大小作为输入回声地图。假设线性传感器阵列结构成像。图像形成假设垂直波传播的回声地图。这个实现是基于方法[1]提出了Yongjian Yu,阿克顿,钢桁架散斑减少各向异性扩散,“IEEE反式。图像处理,11卷,不。11月11日,第1270 - 1260页,2002年。(http://dx.doi.org/10.1109/TIP.2002.804276] [2j . c . Bambre和r . j·迪金森,“超声波B-scanning:计算机模拟”,物理。地中海,杂志。,25卷,不。3、463 - 479年,1980页。(http://dx.doi.org/10.1088/0031-9155/25/3/006]